Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm19445-201ENSMUST00000193649 2438 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Bcas1-203ENSMUST00000109152 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Tmem260-202ENSMUST00000124720 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Mrpl32-202ENSMUST00000220621 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkcshO08795 Prr30-201ENSMUST00000057718 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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