Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
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