Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8050L7N2E3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8050L7N2E3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms