Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm20939L7N243 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm20939L7N243 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Gm20939L7N243 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Gm20939L7N243 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20939L7N243 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Gm20939L7N243 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm20939L7N243 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm20939L7N243 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm20939L7N243 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm20939L7N243 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20939L7N243 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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