Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm3542K7N6U2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm3542K7N6U2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms