Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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