Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
BC024978J3QPC3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms