Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3727J3QM54 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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