Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Cldn34c3J3QJW5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Cldn34c3J3QJW5 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c3J3QJW5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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