Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms