Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Cldn20G5E8X0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Cldn20G5E8X0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn20G5E8X0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Cldn20G5E8X0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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