Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vmn1r34G3XA52 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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