Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Rnf148G3X9R7 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
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Rnf148G3X9R7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Rnf148G3X9R7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Rnf148G3X9R7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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