Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3tc1G3X9F6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3tc1G3X9F6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3tc1G3X9F6 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3tc1G3X9F6 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3tc1G3X9F6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3tc1G3X9F6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3tc1G3X9F6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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