Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34aG3UW52 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34aG3UW52 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34aG3UW52 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn34aG3UW52 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn34aG3UW52 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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