Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ScaperF8VQ70 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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