Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Usp9yF8VPU6 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Usp9yF8VPU6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Usp9yF8VPU6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Usp9yF8VPU6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Usp9yF8VPU6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms