Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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