Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm340F6RGI3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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