Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ddx60E9PZQ1 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ddx60E9PZQ1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddx60E9PZQ1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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