Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Srp54bE9PXC0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms