Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccdc175E9PVB3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms