Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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