Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms