Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb3D3Z6J4 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms