Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms