Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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Ccdc6D3YZP9 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc6D3YZP9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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