Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rnf217D3YYI7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms