Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usf3B2RUQ2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms