Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms