Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Grik3B1AS29 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms