Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Odf2A3KGV1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms