Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atp8b5A3FIN4 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms