Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Rnf39A2RT81 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rnf39A2RT81 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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