Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Samt1A2BED8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms