Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtf1A2AQ19 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms