Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pramef6A2A8M8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pramef6A2A8M8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pramef6A2A8M8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pramef6A2A8M8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pramef6A2A8M8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pramef6A2A8M8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pramef6A2A8M8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms