Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calcoco2A2A6M5 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calcoco2A2A6M5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms