Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lrit3W8DXL4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms