Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Mbd1Q9Z2E2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mbd1Q9Z2E2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mbd1Q9Z2E2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mbd1Q9Z2E2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mbd1Q9Z2E2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mbd1Q9Z2E2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Mbd1Q9Z2E2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms