Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccl8Q9Z121 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms