Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn13Q9Z0S4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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