Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vax2Q9WTP9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vax2Q9WTP9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms