Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam50bQ9WTJ8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms