Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh11Q9QYF1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms