Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Fscn3Q9QXW4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Fscn3Q9QXW4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Fscn3Q9QXW4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Fscn3Q9QXW4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Fscn3Q9QXW4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Fscn3Q9QXW4 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Fscn3Q9QXW4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Fscn3Q9QXW4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Fscn3Q9QXW4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Fscn3Q9QXW4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Fscn3Q9QXW4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Fscn3Q9QXW4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fscn3Q9QXW4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms