Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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