Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc2lQ9JME7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms