Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmod4Q9JLH8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmod4Q9JLH8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms