Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tuba8Q9JJZ2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms